Ministrstvo za zdravje vodi: 

• dr. Valentina Prevolnik Rupel

Ministrstvo za zdravje so od leta 1990 vodili:

• dr. Robert Golob, predsednik Vlade RS v funkciji ministra za zdravje: 13. 7. 2023–13. 10. 2023
• Danijel Bešič Loredan: 1. 6. 2022–13. 7. 2023
• Janez Poklukar: 23. 2. 2021–1. 6. 2022
• Janez Janša, predsednik Vlade RS v funkciji ministra za zdravje: 18. 12. 2020–23. 2. 2021
• Tomaž Gantar: 13. 3. 2020–18. 12. 2020
• Aleš Šabeder: 27. 3. 2019–13. 3. 2020
• Marjan Šarec, predsednik Vlade RS v funkciji ministra za zdravje: 21. 3. 2019–26. 3. 2019
• Samo Fakin: 13. 9. 2018–20. 3. 2019
• Milojka Kolar Celarc: 18. 9. 2014–13. 9. 2018
• mag. Alenka Bratušek, predsednica vlade v funkciji ministrice za zdravje: 16. 4. 2014–18. 9. 2014
• dr. Alenka Trop Skaza:  25. 2. 2014–15. 4. 2014
• Karl Erjavec, minister v funkciji ministra za zdravje: 12. 12. 2013–24. 2. 2014
• Tomaž Gantar: 11. 2. 2012–11. 12. 2013
• Dorijan Marušič: 7. 4. 2010–10. 2. 2012
• Borut Miklavčič: 22. 11. 2008–7. 4. 2010
• Zofija Mazej Kukovič: 11. 9. 2007–21. 11. 2008
• mag. Andrej Bručan: 3. 12. 2004–10. 9. 2007
• dr. Dušan Keber: 30. 11. 2000–3. 12. 2004
• mag. Andrej Bručan: 7. 6. 2000–30. 11. 2000
• dr. Marjan Jereb: 27. 1. 1997–7. 6. 2000
• dr. Božidar Voljč: 15. 1. 1992–27. 2. 1997
• dr. Katja Boh: 16. 5. 1990–15. 1. 1992