Izvajanje Interreg programov, sofinanciranih iz Evropskega sklada za regionalni razvoj, je namenjeno krepitvi čezmejnega, medregionalnega in transnacionalnega sodelovanja na številnih področjih, tako na notranjih kot tudi na zunanjih mejah EU.

V programskem obdobju 2021–2027 Slovenija sodeluje v štirih čezmejnih programih (Slovenija-Avstrija, Slovenija-Madžarska, Slovenija-Hrvaška in Italija-Slovenija) in petih transnacionalnih programih (Območje Alp, Srednja Evropa, Mediteran, Podonavje in Jadransko-jonski program (ADRION).

Izvajanje Norveškega finančnega mehanizma in Finančnega mehanizma EGP je namenjeno zmanjšanju gospodarskih in socialnih razlik ter krepitvi dvostranskih odnosov med državami donatoricami (Norveško, Islandijo in Lihtenštajnom) in državami upravičenkami. V Sloveniji se v programskem obdobju 2014-2021 izvaja v okviru dveh programov (Program izobraževanje – krepitev človeških virov in Program blaženje podnebnih sprememb in prilagajanje nanje), sredstva pa so namenjena tudi skladu za bilateralne odnose.

Sektor za finančne mehanizme Urada za Interreg in finančne mehanizme na Ministrstvu za kohezijo in regionalni razvoj deluje kot nacionalni koordinacijski organ (NKO) v okviru švicarsko-slovenskega programa sodelovanja. Vodja Sektorja za finančne mehanizme deluje kot vodja NKO.