V Sekretariatu smo odgovorni za nemoteno in učinkovito poslovanje organa. Usklajujemo delo strokovnih služb in drugih notranjih organizacijskih enot ter skrbimo za nemoten potek notranjih organizacijskih procesov. V uradu opravljamo strokovno-tehnične naloge: pravne naloge, javno naročanje, finančno poslovanje, kadrovsko poslovanje, varstvo osebnih podatkov, dostop do informacij javnega značaja, načrt integritete in preprečevanje korupcije, upravljanje prostorov in opreme, upravljanje informacijsko-komunikacijske tehnologije, poslovanje z dokumentarnim gradivom in arhivom, naloge s področja obrambnega načrtovanja ter druge strokovne, tehnične in administrativne naloge.