Varstvo vojnih grobišč se izvaja skladno z Zakonom o vojnih grobiščih (Uradni list RS, št. 65/03, 72/09 in 32/17) in zajema naloge evidentiranja vojnih grobišč, upravljanja, urejanja, označevanja vojnih grobišč, vodenja registra vojnih grobišč in pripravo letnega programa varstva vojnih grobišč.

Izvajanje varstva prikritih vojnih grobišč pa določa Zakon o prikritih vojnih grobiščih in pokopu žrtev (Uradni list RS, št. 55/15 in 92/21) ter zajema naloge odkrivanja, zbiranja in obdelovanja podatkov, evidentiranja, začasne obeležitve in zavarovanja, potrjevanja domnevnega vojnega grobišča, identifikacije in izvedbe prekopa ter podaje predloga za vpis v register.

V okviru letnega programa sektor izvaja postopke rednega vzdrževanja vojnih grobišč ter postopke interventnih in investicijskih obnov. Sektor vodi upravne postopke za vpis v register vojnih grobišč ter postopke izdaje dovoljenj za prekope ali druge posege na območju vojnih grobišč.

Sektor opravlja tudi strokovne, tehnične in administrativne naloge ter zagotavlja sredstva za delo Komisije Vlade Republike Slovenije za reševanje vprašanj prikritih grobišč.

Pripravlja predloge sistemskih rešitev, strokovna mnenja, navodila, informacije in druge akte z delovnega področja sektorja.